The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
|
Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
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Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 90 - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 100 | 5 | 1 | 0 | 0 | --1:59:52 | 00:00:28 | 0.02 | 87.28 | -0.05 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server100 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PaFold | 7 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server101 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HeliXonAI | -8 | 1 | 0 | 0 | -76:36:40 | 00:00:21 | -2.71 | 87.28 | -3.06 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server104 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RocketX | -8 | 1 | 0 | 0 | -41:25:58 | 00:00:21 | 21.37 | 87.28 | 18.88 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server106 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OpenComplex | -8 | 1 | 0 | 0 | -48:54:01 | 00:00:21 | -2.35 | 87.28 | -2.49 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server111 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SADA | -8 | 1 | 0 | 0 | -78:23:48 | 00:00:21 | -2.44 | 87.28 | -3.10 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server112 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD7 | -4 | 1 | 0 | 0 | -50:51:48 | 00:00:22 | 35.93 | 87.28 | 29.67 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server113 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta | 7 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server11 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ZJUT-DeepAssembly | -8 | 1 | 0 | 0 | -72:41:37 | 00:00:21 | -2.44 | 87.28 | -3.10 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server120 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MultiDFold | -8 | 1 | 0 | 0 | -79:47:11 | 00:00:21 | 14.56 | 87.28 | 17.15 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server121 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MEGA-EvoGen | -8 | 1 | 0 | 0 | -47:57:42 | 00:00:21 | -2.77 | 87.28 | -3.01 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server122 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AIRFold | -8 | 1 | 0 | 0 | -27:09:38 | 00:00:21 | -3.01 | 87.28 | -3.19 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server127 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ManiFold | -8 | 1 | 0 | 0 | -59:01:15 | 00:00:21 | -1.20 | 87.28 | -1.86 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server129 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PAthreader | -8 | 1 | 0 | 0 | -25:01:16 | 00:00:21 | -1.81 | 87.28 | -2.30 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server130 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -7 | 1 | 0 | 0 | -01:06:59 | 00:00:21 | 53.29 | 87.28 | 38.27 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | -4 | 0 | 0 | 0 | -52:07:00 | 00:00:16 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -7 | 1 | 0 | 0 | -00:05:16 | 00:00:20 | 53.02 | 87.28 | 42.24 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | 7 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server22 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | 7 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server30 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD3-TS | -8 | 1 | 0 | 0 | -45:36:10 | 00:00:21 | 41.18 | 87.28 | 33.24 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | -5 | 0 | 0 | 0 | -00:00:11 | 00:00:17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server36 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD4-TS | -8 | 1 | 0 | 0 | -72:10:10 | 00:00:21 | 42.21 | 87.28 | 34.23 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | -6 | 1 | 0 | 0 | -04:14:03 | 00:00:22 | 65.18 | 87.28 | 47.31 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D | -4 | 1 | 0 | 0 | -03:55:20 | 00:00:23 | 64.44 | 87.28 | 47.18 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server62 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 5 | 0 | 0 | 0 | -06:48:15 | 00:00:15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL | 5 | 1 | 0 | 0 | -02:25:51 | 00:00:41 | 66.28 | 87.28 | 48.79 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server64 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL | -7 | 1 | 0 | 0 | -03:45:28 | 00:00:22 | 65.18 | 87.28 | 47.31 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server65 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | -8 | 1 | 0 | 0 | -35:31:47 | 00:00:21 | 42.59 | 87.28 | 35.29 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS | -6 | 1 | 0 | 0 | -30:47:57 | 00:00:23 | 33.39 | 87.28 | 30.31 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server90 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pureAF2_orig | -8 | 1 | 0 | 0 | -11:42:52 | 00:00:21 | -2.23 | 87.28 | -2.78 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server96 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pureAF2_notemp | -8 | 1 | 0 | 0 | -13:23:29 | 00:00:21 | -2.22 | 87.28 | -2.90 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server97 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ZlxFold | 7 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server98 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate | -7 | 1 | 0 | 0 | -04:38:45 | 00:00:22 | 31.26 | 87.28 | 27.06 | 80.94 | - | - | - | - | - | - | server999 | False |
Target
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ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
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Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |