CAMEO-3D: Server Pairwise Comparison 1-week Performance (2022-04-16)
The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
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Server Name
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Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NaiveBLAST - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Naive AlphaFoldDB 100 | 10 | 1 | 0 | 0 | --1:59:57 | 00:00:22 | 27.44 | 80.93 | 17.32 | 72.78 | - | - | - | - | - | - | server100 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaFold | 12 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server101 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HeliXonAI | -3 | 12 | 0 | 0 | -76:39:05 | 00:00:20 | -32.91 | 50.24 | -29.26 | 50.62 | -48.17 | 26.45 | - | - | - | - | server104 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RocketX | -3 | 12 | 0 | 0 | -41:28:03 | 00:00:20 | -5.05 | 50.24 | -8.56 | 50.62 | 0.35 | 26.45 | - | - | - | - | server106 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OpenComplex | -3 | 12 | 0 | 0 | -48:56:03 | 00:00:20 | -31.35 | 50.24 | -28.69 | 50.62 | -32.87 | 26.45 | - | - | - | - | server111 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SADA | -3 | 12 | 0 | 0 | -78:25:28 | 00:00:20 | -30.90 | 50.24 | -29.04 | 50.62 | -41.42 | 26.45 | - | - | - | - | server112 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntFOLD7 | 1 | 9 | 0 | 0 | -39:57:36 | 00:00:18 | -19.49 | 53.01 | -17.55 | 53.12 | -77.19 | 17.61 | - | - | - | - | server113 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Robetta | 12 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server11 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ZJUT-DeepAssembly | -3 | 12 | 0 | 0 | -73:07:11 | 00:00:20 | -31.45 | 50.24 | -28.87 | 50.62 | -41.07 | 26.45 | - | - | - | - | server120 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MultiDFold | -3 | 12 | 0 | 0 | -79:49:27 | 00:00:20 | -17.71 | 50.24 | -17.84 | 50.62 | -26.81 | 26.45 | - | - | - | - | server121 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MEGA-EvoGen | -3 | 12 | 0 | 0 | -47:59:44 | 00:00:20 | -33.32 | 50.24 | -29.96 | 50.62 | -25.55 | 26.45 | - | - | - | - | server122 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| AIRFold | -3 | 12 | 0 | 0 | -27:03:46 | 00:00:20 | -30.49 | 50.24 | -27.99 | 50.62 | -26.16 | 26.45 | - | - | - | - | server127 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ManiFold | -3 | 12 | 0 | 0 | -58:46:43 | 00:00:20 | -30.08 | 50.24 | -27.51 | 50.62 | -28.41 | 26.45 | - | - | - | - | server129 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PAthreader | -3 | 12 | 0 | 0 | -25:01:19 | 00:00:20 | -31.70 | 50.24 | -28.49 | 50.62 | -38.05 | 26.45 | - | - | - | - | server130 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phyre2 | -2 | 11 | 0 | 0 | -01:08:41 | 00:00:21 | -0.59 | 53.57 | -4.27 | 53.27 | -16.77 | 26.45 | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RoseTTAFold | 1 | 9 | 0 | 0 | -50:59:05 | 00:00:16 | -27.91 | 45.25 | -26.10 | 46.08 | -25.17 | 37.81 | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SWISS-MODEL | -2 | 11 | 0 | 0 | -00:05:10 | 00:00:20 | -11.82 | 52.40 | -12.49 | 52.49 | -4.76 | 26.45 | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RaptorX | 12 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server22 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SPARKS-X | 12 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server30 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntFOLD3-TS | -3 | 12 | 0 | 0 | -42:20:04 | 00:00:20 | -12.18 | 50.24 | -13.25 | 50.62 | -21.30 | 26.45 | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntFOLD4-TS | -3 | 12 | 0 | 0 | -62:17:04 | 00:00:20 | -16.33 | 50.24 | -16.00 | 50.62 | -26.25 | 26.45 | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIMO | -1 | 10 | 0 | 0 | -03:15:17 | 00:00:20 | 2.24 | 50.48 | 1.13 | 51.17 | 0.32 | 30.87 | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIMO_BST_3D | 1 | 8 | 0 | 0 | -03:02:54 | 00:00:17 | 1.60 | 42.19 | -1.04 | 44.40 | -10.72 | 30.87 | - | - | - | - | server62 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIMO_HHS_3D | 10 | 2 | 0 | 0 | -04:24:31 | 00:00:20 | -1.48 | 60.55 | -0.99 | 64.31 | - | - | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIMO_HHS_CL | 10 | 1 | 0 | 0 | -04:13:37 | 00:00:10 | -0.55 | 37.23 | -0.14 | 50.14 | - | - | - | - | - | - | server64 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIMO_BST_CL | -2 | 11 | 0 | 0 | -03:14:04 | 00:00:19 | 0.40 | 47.19 | -1.21 | 48.08 | -3.21 | 26.45 | - | - | - | - | server65 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntFOLD5-TS | -3 | 12 | 0 | 0 | -29:40:50 | 00:00:20 | -17.15 | 50.24 | -16.07 | 50.62 | -29.28 | 26.45 | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntFOLD6-TS | -1 | 10 | 0 | 0 | -26:06:26 | 00:00:18 | -21.48 | 43.44 | -19.01 | 45.05 | -37.51 | 26.45 | - | - | - | - | server90 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| pureAF2_orig | -3 | 12 | 0 | 0 | -14:24:28 | 00:00:20 | -32.31 | 50.24 | -29.35 | 50.62 | -43.65 | 26.45 | - | - | - | - | server96 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| pureAF2_notemp | -3 | 12 | 0 | 0 | -16:05:42 | 00:00:20 | -29.56 | 50.24 | -27.78 | 50.62 | -26.36 | 26.45 | - | - | - | - | server97 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ZlxFold | 12 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server98 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BestSingleStructuralTemplate | -2 | 11 | 0 | 0 | -04:59:29 | 00:00:19 | -24.46 | 47.19 | -21.86 | 48.08 | -27.40 | 26.45 | - | - | - | - | server999 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Naive AlphaFoldDB 90 | 5 | 5 | 0 | 0 | --1:59:49 | 00:00:28 | 10.52 | 83.46 | 9.47 | 77.34 | - | - | - | - | - | - | server99 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Target
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ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
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| Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | |||