The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
|
Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 100 | 113 | 173 | 0 | 0 | --5:17:37 | 04:52:38 | -11.47 | 69.90 | -9.59 | 68.79 | -7.57 | 71.81 | - | - | - | - | server100 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PaFold | 311 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server101 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HeliXonAI | 311 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server104 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OpenComplex | -27 | 300 | 0 | 0 | -11:47:50 | 04:55:24 | -15.19 | 70.05 | -12.29 | 68.68 | -11.97 | 71.73 | - | - | - | - | server111 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD7 | 11 | 263 | 0 | 0 | -31:25:05 | 04:49:00 | -9.26 | 70.67 | -7.90 | 69.07 | -5.44 | 73.37 | - | - | - | - | server113 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta | 309 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server11 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ZJUT-DeepAssembly | 119 | 167 | 0 | 0 | -69:41:18 | 04:47:45 | -12.22 | 72.63 | -10.04 | 70.68 | -11.01 | 74.39 | - | - | - | - | server120 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MultiDFold | 46 | 225 | 0 | 0 | -71:03:44 | 04:56:27 | -13.07 | 71.37 | -10.66 | 69.75 | -11.24 | 71.37 | - | - | - | - | server121 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MEGA-EvoGen | 206 | 84 | 0 | 0 | -67:14:45 | 05:37:00 | -15.93 | 70.90 | -12.52 | 69.40 | -16.02 | 66.17 | - | - | - | - | server122 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AIRFold | -11 | 286 | 0 | 0 | -10:27:59 | 05:00:23 | -15.25 | 70.33 | -12.35 | 68.94 | -10.54 | 71.87 | - | - | - | - | server127 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ManiFold | -6 | 280 | 0 | 0 | -36:34:35 | 04:59:52 | -14.93 | 70.02 | -12.17 | 68.68 | -11.22 | 72.28 | - | - | - | - | server129 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PAthreader | 43 | 228 | 0 | 0 | -61:31:55 | 04:55:42 | -13.45 | 71.41 | -11.01 | 69.77 | -11.90 | 71.37 | - | - | - | - | server130 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PAthreader2 | 86 | 189 | 0 | 0 | -59:30:22 | 04:58:24 | -13.03 | 71.68 | -10.80 | 69.94 | -10.67 | 72.78 | - | - | - | - | server131 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -10 | 289 | 0 | 0 | --4:47:05 | 04:51:57 | 16.39 | 70.21 | 13.53 | 68.87 | 10.22 | 71.40 | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | 38 | 240 | 0 | 0 | -06:09:52 | 05:00:50 | -3.30 | 70.15 | -3.10 | 68.72 | 2.39 | 70.52 | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -38 | 307 | 0 | 0 | --5:08:28 | 04:57:09 | 8.54 | 70.27 | 7.62 | 68.84 | 4.41 | 71.61 | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | 311 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server22 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | 311 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server30 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD3-TS | -40 | 310 | 0 | 0 | -42:56:32 | 04:52:54 | 7.05 | 70.07 | 5.75 | 68.72 | 4.64 | 71.61 | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | 15 | 259 | 0 | 0 | --5:08:06 | 04:52:23 | 16.40 | 72.21 | 15.92 | 70.29 | 9.20 | 73.07 | - | - | - | - | server36 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD4-TS | -12 | 288 | 0 | 0 | -51:52:04 | 04:45:30 | 5.21 | 69.93 | 4.03 | 68.63 | 3.07 | 72.46 | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | 62 | 225 | 0 | 0 | --2:20:36 | 04:48:49 | 16.96 | 70.12 | 14.26 | 68.86 | 12.62 | 71.67 | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D | 101 | 186 | 0 | 0 | --2:24:11 | 04:46:55 | 20.99 | 69.10 | 17.69 | 68.14 | 15.27 | 70.10 | - | - | - | - | server62 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 242 | 62 | 0 | 0 | --1:07:19 | 04:21:48 | 24.03 | 66.48 | 20.02 | 66.43 | 12.10 | 77.25 | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL | 228 | 75 | 0 | 0 | --1:38:04 | 03:53:10 | 20.21 | 64.87 | 16.78 | 65.00 | 15.26 | 71.99 | - | - | - | - | server64 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL | 69 | 216 | 0 | 0 | --2:31:20 | 04:44:26 | 18.34 | 69.56 | 15.25 | 68.29 | 14.33 | 71.72 | - | - | - | - | server65 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | -41 | 310 | 0 | 0 | -28:28:10 | 04:52:54 | 4.77 | 70.07 | 3.54 | 68.72 | 2.66 | 71.61 | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS | -15 | 290 | 0 | 0 | -21:34:35 | 04:56:38 | 4.38 | 70.57 | 3.33 | 69.05 | 2.49 | 71.86 | - | - | - | - | server90 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 90 | 37 | 239 | 0 | 0 | --5:05:51 | 05:04:06 | -12.75 | 68.72 | -10.40 | 67.83 | -9.39 | 71.14 | - | - | - | - | server99 | False |
Target
|
ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |