The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
|
Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta | 47 | 632 | 0 | 0 | --20:58:01 | 30:39:01 | -4.83 | 67.55 | -4.31 | 66.86 | 1.11 | 67.65 | - | - | - | - | server11 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -37 | 699 | 0 | 0 | --30:46:43 | 30:45:13 | 12.84 | 67.82 | 9.61 | 66.97 | 6.83 | 68.40 | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | 8 | 658 | 0 | 0 | --20:39:23 | 29:28:36 | -6.25 | 67.84 | -5.19 | 67.04 | 1.61 | 68.42 | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -39 | 701 | 0 | 0 | --31:08:39 | 31:11:55 | 3.77 | 67.83 | 4.07 | 66.95 | 4.38 | 68.52 | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | 210 | 471 | 0 | 0 | --15:20:52 | 31:03:45 | 1.27 | 68.06 | 0.48 | 67.17 | 4.05 | 68.96 | - | - | - | - | server22 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | 426 | 278 | 0 | 0 | --16:24:02 | 30:29:24 | 10.26 | 66.94 | 6.38 | 66.30 | 2.67 | 67.68 | - | - | - | - | server30 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD3-TS | 0 | 697 | 0 | 0 | -09:23:33 | 30:44:39 | 2.97 | 67.64 | 2.69 | 66.87 | 2.42 | 68.07 | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | 57 | 610 | 0 | 0 | --32:59:11 | 31:01:21 | 12.66 | 69.19 | 12.92 | 67.81 | 10.09 | 68.43 | - | - | - | - | server36 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD4-TS | 67 | 633 | 0 | 0 | -27:13:51 | 29:45:20 | 1.15 | 67.48 | 1.07 | 66.81 | 0.93 | 67.36 | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | 366 | 327 | 0 | 0 | --27:34:37 | 29:20:59 | 12.74 | 66.80 | 10.83 | 66.31 | 13.92 | 65.56 | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D | 429 | 267 | 0 | 0 | --27:23:19 | 29:40:06 | 15.35 | 65.79 | 13.06 | 65.42 | 16.20 | 64.47 | - | - | - | - | server62 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 615 | 86 | 0 | 0 | --23:50:48 | 25:25:47 | 16.49 | 65.45 | 13.39 | 65.61 | 9.01 | 67.89 | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL | 596 | 107 | 0 | 0 | --22:53:18 | 24:24:09 | 12.92 | 64.94 | 10.53 | 65.56 | 9.13 | 64.31 | - | - | - | - | server64 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL | 384 | 309 | 0 | 0 | --27:25:11 | 29:31:01 | 12.78 | 66.58 | 10.78 | 66.11 | 14.49 | 66.90 | - | - | - | - | server65 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | 40 | 655 | 0 | 0 | -09:54:47 | 29:42:06 | 0.67 | 67.60 | 0.50 | 66.86 | 0.86 | 68.04 | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate | 9 | 660 | 0 | 0 | --26:22:38 | 30:05:23 | -3.95 | 67.83 | -3.04 | 66.97 | -0.78 | 68.86 | - | - | - | - | server999 | False |
Target
|
ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |