The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
|
Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
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Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta | -337 | 156 | 0 | 0 | -09:15:39 | 02:55:22 | -20.22 | 52.73 | -17.40 | 54.08 | -12.96 | 51.68 | - | - | - | - | server11 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -421 | 179 | 0 | 0 | --2:16:49 | 02:59:58 | -1.20 | 50.37 | -2.83 | 52.32 | -6.78 | 49.17 | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | -376 | 162 | 0 | 0 | -08:21:45 | 02:57:34 | -23.90 | 49.77 | -20.18 | 52.01 | -17.19 | 49.35 | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -423 | 181 | 0 | 0 | --3:30:52 | 02:58:44 | -10.15 | 50.33 | -7.80 | 52.31 | -8.72 | 49.17 | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | -174 | 98 | 0 | 0 | -08:47:54 | 03:01:21 | -14.25 | 50.87 | -12.54 | 52.82 | -7.99 | 48.44 | - | - | - | - | server22 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | 42 | 36 | 0 | 0 | -09:47:14 | 02:43:03 | -0.65 | 56.31 | -3.51 | 56.12 | -3.33 | 63.19 | - | - | - | - | server30 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD3-TS | -384 | 173 | 0 | 0 | -35:03:48 | 02:56:20 | -11.04 | 50.87 | -9.24 | 52.66 | -11.80 | 50.01 | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | -327 | 160 | 0 | 0 | --3:00:32 | 03:00:05 | 2.44 | 51.90 | 3.93 | 53.22 | -2.13 | 49.18 | - | - | - | - | server36 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD4-TS | -317 | 165 | 0 | 0 | -50:55:24 | 02:55:05 | -13.55 | 50.19 | -11.19 | 52.29 | -14.89 | 49.65 | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | -18 | 168 | 0 | 0 | --1:59:33 | 02:52:29 | 0.00 | 49.68 | 0.00 | 51.79 | 0.00 | 47.57 | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D | 45 | 149 | 0 | 0 | -00:14:58 | 02:45:47 | 2.96 | 49.68 | 2.42 | 51.83 | 0.52 | 43.15 | - | - | - | - | server62 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 231 | 44 | 0 | 0 | -01:13:46 | 01:58:48 | -0.22 | 44.41 | 0.61 | 49.22 | -8.24 | 41.75 | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL | 212 | 45 | 0 | 0 | -01:08:24 | 02:06:25 | -7.84 | 43.22 | -5.71 | 48.61 | -5.41 | 51.10 | - | - | - | - | server64 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | -344 | 165 | 0 | 0 | -30:22:28 | 02:55:05 | -13.17 | 51.11 | -11.38 | 52.79 | -14.57 | 48.34 | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS | -384 | 174 | 0 | 0 | -26:34:49 | 02:56:12 | -15.04 | 50.41 | -12.43 | 52.39 | -16.88 | 48.78 | - | - | - | - | server90 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate | -375 | 174 | 0 | 0 | -01:10:05 | 02:54:11 | -18.43 | 50.41 | -15.30 | 52.45 | -14.10 | 48.61 | - | - | - | - | server999 | False |
Target
|
ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
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Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |