The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
|
Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
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Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta | -337 | 277 | 0 | 0 | -09:15:39 | 02:55:22 | -17.67 | 54.53 | -15.16 | 55.93 | -12.79 | 52.71 | - | - | - | - | server11 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -421 | 321 | 0 | 0 | --2:16:49 | 02:59:58 | 0.40 | 53.78 | -0.46 | 55.31 | -6.34 | 51.95 | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | -376 | 293 | 0 | 0 | -08:21:45 | 02:57:34 | -19.73 | 54.21 | -16.62 | 55.71 | -13.27 | 53.73 | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -423 | 321 | 0 | 0 | --3:30:52 | 02:58:44 | -8.22 | 53.85 | -6.00 | 55.34 | -8.21 | 51.95 | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | -174 | 179 | 0 | 0 | -08:47:54 | 03:01:21 | -12.34 | 53.26 | -11.12 | 54.97 | -11.65 | 48.99 | - | - | - | - | server22 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | 42 | 57 | 0 | 0 | -09:47:14 | 02:43:03 | -0.88 | 49.25 | -3.73 | 51.78 | -8.71 | 49.30 | - | - | - | - | server30 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD3-TS | -384 | 307 | 0 | 0 | -35:03:48 | 02:56:20 | -9.32 | 53.93 | -7.89 | 55.36 | -11.27 | 52.70 | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | -327 | 278 | 0 | 0 | --3:00:32 | 03:00:05 | 2.24 | 56.38 | 3.85 | 56.90 | -1.40 | 53.12 | - | - | - | - | server36 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD4-TS | -317 | 295 | 0 | 0 | -50:55:24 | 02:55:05 | -11.37 | 53.95 | -9.70 | 55.43 | -12.15 | 53.05 | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | -18 | 291 | 0 | 0 | --1:59:33 | 02:52:29 | 0.00 | 52.98 | 0.00 | 54.66 | 0.00 | 50.03 | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D | 45 | 252 | 0 | 0 | -00:14:58 | 02:45:47 | 2.98 | 52.74 | 2.60 | 54.54 | 0.81 | 47.68 | - | - | - | - | server62 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 231 | 75 | 0 | 0 | -01:13:46 | 01:58:48 | 1.94 | 47.19 | 1.90 | 51.19 | -2.15 | 48.81 | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL | 212 | 86 | 0 | 0 | -01:08:24 | 02:06:25 | -3.95 | 46.50 | -2.88 | 51.12 | -2.64 | 51.28 | - | - | - | - | server64 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | -344 | 295 | 0 | 0 | -30:22:28 | 02:55:05 | -11.46 | 54.09 | -10.01 | 55.50 | -12.23 | 52.09 | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS | -384 | 309 | 0 | 0 | -26:34:49 | 02:56:12 | -12.78 | 53.80 | -10.78 | 55.33 | -14.49 | 52.40 | - | - | - | - | server90 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate | -375 | 304 | 0 | 0 | -01:10:05 | 02:54:11 | -16.68 | 53.80 | -13.73 | 55.41 | -13.58 | 52.77 | - | - | - | - | server999 | False |
Target
|
ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
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Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |