The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
|
Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
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Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta | -382 | 241 | 0 | 0 | -08:32:14 | 03:01:59 | -20.17 | 51.81 | -17.57 | 53.41 | -15.20 | 49.22 | - | - | - | - | server11 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -466 | 278 | 0 | 0 | --2:08:26 | 03:06:35 | -1.51 | 50.43 | -2.45 | 52.35 | -7.76 | 47.96 | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | -421 | 254 | 0 | 0 | -07:41:07 | 03:06:26 | -22.65 | 50.75 | -19.38 | 52.57 | -17.06 | 49.17 | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -468 | 277 | 0 | 0 | --3:22:31 | 03:04:45 | -10.20 | 50.51 | -7.78 | 52.42 | -9.05 | 47.96 | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | -219 | 153 | 0 | 0 | -08:57:10 | 03:05:49 | -14.00 | 50.04 | -12.92 | 52.18 | -15.30 | 44.68 | - | - | - | - | server22 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | -3 | 50 | 0 | 0 | -09:47:40 | 02:48:35 | -1.63 | 48.13 | -4.44 | 50.95 | -12.62 | 47.68 | - | - | - | - | server30 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD3-TS | -429 | 263 | 0 | 0 | -35:21:46 | 03:03:07 | -11.51 | 50.52 | -9.96 | 52.39 | -12.90 | 48.38 | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | -372 | 244 | 0 | 0 | --4:53:30 | 03:07:11 | 0.25 | 52.54 | 2.33 | 53.85 | -1.82 | 47.33 | - | - | - | - | server36 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD4-TS | -362 | 252 | 0 | 0 | -50:53:39 | 03:02:44 | -13.77 | 50.58 | -11.78 | 52.50 | -14.27 | 49.38 | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | -63 | 259 | 0 | 0 | --1:44:24 | 03:03:01 | -2.82 | 49.58 | -2.46 | 51.77 | -1.10 | 45.88 | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 186 | 71 | 0 | 0 | -00:53:00 | 02:18:09 | -1.99 | 43.45 | -1.46 | 47.94 | -8.62 | 45.72 | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL | 167 | 75 | 0 | 0 | -00:59:36 | 02:10:26 | -5.82 | 45.03 | -4.37 | 49.43 | -8.72 | 50.50 | - | - | - | - | server64 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL | -45 | 252 | 0 | 0 | --1:45:02 | 03:00:45 | -2.98 | 49.76 | -2.60 | 51.94 | -0.81 | 46.87 | - | - | - | - | server65 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | -389 | 252 | 0 | 0 | -30:28:52 | 03:04:41 | -13.81 | 50.99 | -12.05 | 52.75 | -13.72 | 48.83 | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS | -429 | 267 | 0 | 0 | -26:36:41 | 03:03:25 | -15.35 | 50.43 | -13.06 | 52.36 | -16.20 | 48.28 | - | - | - | - | server90 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate | -420 | 265 | 0 | 0 | -01:04:59 | 03:00:07 | -18.75 | 50.06 | -15.90 | 52.18 | -15.31 | 47.62 | - | - | - | - | server999 | False |
Target
|
ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
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Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |