The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
|
Targets modeled |
Oligo-Targets modeled |
Avg. Response Time (hh:mm:ss) |
Avg. lDDT |
Avg. CAD-score |
Avg. lDDT-BS |
Avg. QS-score |
Avg. MM-align |
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Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 100 | 0 | 1 | 0 | 0 | --3:33:48 | 02:26:32 | -66.26 | 21.00 | -48.84 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server100 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PaFold | 2 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server101 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HeliXonAI | -13 | 1 | 0 | 0 | -73:16:44 | 03:20:10 | -68.99 | 21.00 | -51.85 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server104 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RocketX | -13 | 1 | 0 | 0 | -38:06:05 | 03:20:10 | -44.91 | 21.00 | -29.92 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server106 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OpenComplex | -13 | 1 | 0 | 0 | -45:34:14 | 03:20:10 | -68.63 | 21.00 | -51.28 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server111 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SADA | -13 | 1 | 0 | 0 | -75:03:12 | 03:20:10 | -68.72 | 21.00 | -51.89 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server112 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD7 | -9 | 1 | 0 | 0 | -22:03:11 | 03:20:10 | -30.35 | 21.00 | -19.12 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server113 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta | 2 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server11 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ZJUT-DeepAssembly | -13 | 1 | 0 | 0 | -69:21:46 | 03:20:10 | -68.72 | 21.00 | -51.89 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server120 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MultiDFold | -13 | 1 | 0 | 0 | -76:27:18 | 03:20:10 | -51.72 | 21.00 | -31.64 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server121 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MEGA-EvoGen | -13 | 1 | 0 | 0 | -44:37:40 | 03:20:10 | -69.05 | 21.00 | -51.80 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server122 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AIRFold | -13 | 1 | 0 | 0 | -21:57:38 | 03:20:10 | -69.29 | 21.00 | -51.98 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server127 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ManiFold | -13 | 1 | 0 | 0 | -55:54:37 | 03:20:10 | -67.48 | 21.00 | -50.65 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server129 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PAthreader | -13 | 1 | 0 | 0 | -21:41:40 | 03:20:10 | -68.09 | 21.00 | -51.09 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server130 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -12 | 1 | 0 | 0 | --3:02:15 | 03:20:10 | -12.99 | 21.00 | -10.53 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server17 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | -9 | 0 | 0 | 0 | -17:24:03 | 04:13:47 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server19 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -12 | 1 | 0 | 0 | --4:41:31 | 03:20:10 | -13.26 | 21.00 | -6.55 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server20 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | 2 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server22 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | 2 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server30 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD3-TS | -13 | 1 | 0 | 0 | -32:01:53 | 03:20:10 | -25.10 | 21.00 | -15.55 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server33 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | -10 | 0 | 0 | 0 | --5:46:23 | 04:13:47 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server36 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD4-TS | -13 | 1 | 0 | 0 | -43:18:02 | 03:20:10 | -24.07 | 21.00 | -14.56 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server58 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | -11 | 1 | 0 | 0 | --2:04:27 | 03:20:10 | -1.10 | 21.00 | -1.49 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server61 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D | -9 | 1 | 0 | 0 | --1:02:02 | 03:20:10 | -1.84 | 21.00 | -1.62 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server62 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 0 | 0 | 0 | 0 | --3:47:24 | 04:13:47 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server63 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL | -12 | 1 | 0 | 0 | --1:25:34 | 03:20:10 | -1.10 | 21.00 | -1.49 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server65 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | -13 | 1 | 0 | 0 | -16:17:39 | 03:20:10 | -23.70 | 21.00 | -13.51 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server75 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS | -11 | 1 | 0 | 0 | -14:00:13 | 03:20:10 | -32.89 | 21.00 | -18.49 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server90 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pureAF2_orig | -13 | 1 | 0 | 0 | -14:23:13 | 03:20:10 | -68.51 | 21.00 | -51.58 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server96 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pureAF2_notemp | -13 | 1 | 0 | 0 | -10:19:16 | 03:20:10 | -68.50 | 21.00 | -51.70 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server97 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ZlxFold | 2 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | server98 | True | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate | -12 | 1 | 0 | 0 | --3:54:58 | 03:20:10 | -35.02 | 21.00 | -21.74 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server999 | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 90 | -5 | 1 | 0 | 0 | --3:34:09 | 02:26:32 | -66.28 | 21.00 | -48.79 | 32.14 | - | - | - | - | - | - | server99 | False |
Target
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ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
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Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |