The pairwise comparison is showing the average differences of the reference with all the other servers, each on a common data subset. It is misleading to compare further servers among each other, without selecting a new reference as for each server pair the common subset may differ. Numbers in green denote scores where the reference server is better, numbers in red where another server was outperforming the reference server.
Server Name
| Targets modeled | Oligo-Targets modeled | Avg. Response Time (hh:mm:ss) | Avg. lDDT | Avg. CAD-score | Avg. lDDT-BS | Avg. QS-score | Avg. MM-align | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta - Reference |
Server Name
| Targets modeled | Oligo-Targets modeled | Avg. Response Time (hh:mm:ss) | Avg. lDDT | Avg. CAD-score | Avg. lDDT-BS | Avg. QS-score | Avg. MM-align | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Dif. | Com. | Dif. | Com. | Dif. | Ref | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | Dif. | Ref. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Robetta - Reference | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 100 | -7 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PaFold | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HeliXonAI | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OpenComplex | -13 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD7 | -14 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MultiDFold | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AIRFold | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SAIS-Fold | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ZJUT-DeepSHFold | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phyre2 | -13 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RoseTTAFold | -14 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SWISS-MODEL | -14 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RaptorX | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SPARKS-X | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NaiveBLAST | -10 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_3D | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_3D | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_HHS_CL | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRIMO_BST_CL | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD5-TS | -14 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IntFOLD6-TS | -14 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BestSingleStructuralTemplate | -12 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naive AlphaFoldDB 90 | -11 | 0 | 0 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Server Name
|
---|
Robetta - Reference |
Target
| ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best |
Target
| ref. PDB | lDDT | CAD-score | lDDT-BS | QS-score | MM-align | Difficulty | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | Diff | Ref | Best | |||
2025-03-08_00000256_1 | 9gpi[D] | - | 86.12 | OpenComplex | - | 80.34 | OpenComplex | - | - | - | - | 0.00 | SWISS-MODEL | - | 0.46 | SWISS-MODEL | Medium |
2025-03-08_00000244_1 | 9fiz[A] | - | 84.01 | IntFOLD7 | - | 79.35 | IntFOLD7 | - | - | - | - | 0.52 | SWISS-MODEL | - | 0.82 | SWISS-MODEL | Medium |
2025-03-08_00000242_1 | 9fhk[B] | - | 84.78 | IntFOLD7 | - | 80.01 | IntFOLD7 | - | - | - | - | 0.56 | SWISS-MODEL | - | 0.80 | SWISS-MODEL | Medium |
2025-03-08_00000217_1 | 9ehu[A] | - | 77.36 | OpenComplex | - | 74.27 | OpenComplex | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Medium |
2025-03-08_00000189_1 | 9ckx[A] | - | 76.42 | IntFOLD7 | - | 76.10 | IntFOLD7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Medium |
2025-03-08_00000098_1 | 8zwz[A] | - | 77.97 | OpenComplex | - | 73.55 | OpenComplex | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Medium |
2025-03-08_00000049_3 | 8xuf[C] | - | 81.88 | OpenComplex | - | 79.84 | OpenComplex | - | 98.99 | IntFOLD7 | - | - | - | - | - | - | Medium |
2025-03-08_00000027_1 | 8s7a[A] | - | 77.66 | IntFOLD7 | - | 75.38 | IntFOLD7 | - | - | - | - | 0.47 | SWISS-MODEL | - | 0.69 | SWISS-MODEL | Medium |
2025-03-08_00000005_1 | 8qce[B] | - | 91.06 | IntFOLD7 | - | 84.66 | OpenComplex | - | 95.28 | Naive AlphaFoldDB 90 | - | - | - | - | - | - | Medium |