2026-08-08_00000075|hard|26PF

Structure of a human monoclonal neutralizing antibody S54 targeting Epstein-Barr virus major glycoprotein gp350; Electron microscopy 3.10Å
Protein #1 120 residues (98% resolved)

VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYYLHWMRQAPGEGLEWVGLINPSVGSASSAQKFKGRVTMTSDTSTSIAYLEVNSLTSEDTAVYYCARVGPSRYSTSSPYWGQGTLVTVSS

VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYYLHWMRQAPGEGLEWVGLINPSVGSASSAQKFKGRVTMTSDTSTSIAYLEVNSLTSEDTAVYYCARVGPSRYSTSSPYWGQGTLVTVSS
Protein #2 109 residues (99% resolved)

QPVLTQSPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNTVNWYQQLPGTAPKLLIYGNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSDDEADYYCSSYTSSSSLVFGGGTKLTVL

QPVLTQSPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNTVNWYQQLPGTAPKLLIYGNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSDDEADYYCSSYTSSSSLVFGGGTKLTVL
Protein #3 864 residues (47% resolved)

MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARGSHHHHHHHHHHEAALLVCQYTIQSLIHLTGEDPGFFNVEIPEFPFYPTCNVCTADVNVTINFDVGGKKHQLDLDFGQLTPHTKAVYQPRGAFGGSENATNLFLLELLGAGELALTMRSKKLPINVTTGEEQQVSLESVDVYFQDVFGTMWCHHAEMQNPVYLIPETVPYIKWDNCNSTNITAVVRAQGLDVTLPLSLPTSAQDSNFSVKTQMLGNEIDIECIMEDGEISQVLPGDNKFNITCSGYESHVPSGGILTSTSPVATPIPGTGYAYSLRLTPRPVSRFLGNNSILYVFYSGNGPKASGGDYCIQSNIVFSDEIPASQDMPTNTTDITYVGDNATYSVPMVTSEDANSPNVTVTAFWAWPNNTETDFKCKWTLTSGTPSGCENISGAFASNRTFDITVSGLGTAPKTLIITRTATNATTTTHKVIFSKAPESTTTSPTLNTTGFADPNTTTGLPSSTHVPTNLTAPASTGPTVSTADVTSPTPAGTTSGASPVTPSPSPRDNGTESKAPDMTSPTSAVTTPTPNGTSPTPAMTTPTPNATSPTLGKTSPTSAVTTPTPNATSPTPAVTTPTPNATSPTVGETSPQANATNHTLGGTSPTPVVTSPPKNATSDVTTGQHNRTSSSTSSMSLRPSSIPETTSHMPLLTSAHPTGGENITQVTPASISTHHVSTSSPAPRPGTTSQASGPGNSSTSTKPGEVNVTKGTPPKNATSPQAPSGQKTAVPTVTSTGGKANSTTGGKHTTGHGARTSTEPTTDYGDDSTTPRPRYNATTYLPPSTSSKLRPRWTFTSPPVTTAQATVPVPPTSQPRFSNLHHHHHHHHHH

MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARGSHHHHHHHHHHEAALLVCQYTIQSLIHLTGEDPGFFNVEIPEFPFYPTCNVCTADVNVTINFDVGGKKHQLDLDFGQLTPHTKAVYQPRGAFGGSENATNLFLLELLGAGELALTMRSKKLPINVTTGEEQQVSLESVDVYFQDVFGTMWCHHAEMQNPVYLIPETVPYIKWDNCNSTNITAVVRAQGLDVTLPLSLPTSAQDSNFSVKTQMLGNEIDIECIMEDGEISQVLPGDNKFNITCSGYESHVPSGGILTSTSPVATPIPGTGYAYSLRLTPRPVSRFLGNNSILYVFYSGNGPKASGGDYCIQSNIVFSDEIPASQDMPTNTTDITYVGDNATYSVPMVTSEDANSPNVTVTAFWAWPNNTETDFKCKWTLTSGTPSGCENISGAFASNRTFDITVSGLGTAPKTLIITRTATNATTTTHKVIFSKAPESTTTSPTLNTTGFADPNTTTGLPSSTHVPTNLTAPASTGPTVSTADVTSPTPAGTTSGASPVTPSPSPRDNGTESKAPDMTSPTSAVTTPTPNGTSPTPAMTTPTPNATSPTLGKTSPTSAVTTPTPNATSPTPAVTTPTPNATSPTVGETSPQANATNHTLGGTSPTPVVTSPPKNATSDVTTGQHNRTSSSTSSMSLRPSSIPETTSHMPLLTSAHPTGGENITQVTPASISTHHVSTSSPAPRPGTTSQASGPGNSSTSTKPGEVNVTKGTPPKNATSPQAPSGQKTAVPTVTSTGGKANSTTGGKHTTGHGARTSTEPTTDYGDDSTTPRPRYNATTYLPPSTSSKLRPRWTFTSPPVTTAQATVPVPPTSQPRFSNLHHHHHHHHHH
Download coordinates
Reference