2026-08-01_00000185|hard|23WO

Cryo-EM structure of the de novo designed metalloprotease DP221 E85Q mutant; Electron microscopy 3.50Å
Protein #1 1503 residues (14% resolved)

MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTEVTVLTASSPDEIPAIAERVLELTGDREVAERVREAMAELWRALAAMPDVVIGGLALLDYPDVVVLVEGPRPASEEARLLTLAHQIAHGIFARLAREAGVDLSLPEVRAANEGVATFAGLAEMLGVASVEEAARAAFDWYLGDPRARERAARLPVTLEQLVRMVREVVKLAEIYRRAREQGLLPAEFTDAHLGGTAVAMDILLFVGEARLEEEAERVERDEDLSEEEKKALRVILTAKALILLALGLLALLARHPDNKEVKELVLRLANLLIEQVERLLEEAKKIEDKVPELAAEAIRLLARALLVLAELLLRLSPYFPEEVKENGRLLGEVALKLLELLKKLLEKAEKEGNKEIHELIAEAIAALIGVADALRRLGLEEEAEELKKKIAELVNKLVESYPEQLFKLIEKTLDHPETLAEVLSQVKLTKELAKELFEKALEAIKEKNYKLAYLYLTAAATNPEMLPKIKELLEKEEDIEVIKVIAKAAITAANNENLTKEQAELLAELLLLALEKLIPDEELLELIIKILKALAKLFKKLDPKTAIEYLKKVTELVLELLEREKDPERIIKLGEALAKLLEGVGENAAKTKDKELVKTAIELAKEVIEKILKRLLEDKSLSPEEVAALVEAIVKIAEGTIKALILAGLLEEALEFLKEVLEKIVETIEQLPDELRPEAIAALLESLGESLVEIAKTALENLPEEEAEKFLKEVLRLILEFLEKLFEIALPLADDKEAVEKIMKGLAKLVGGLLVVLLLVPGVEEEVRRIIRLITEFIEEVFRRMVEKAETEEEREEVREFIAELLLEFLKIIGEKVVKGTEEAVRKGLLKPEGLRAALRLLGELVEALLRLAAELLPEELAREVAREMLEIAFETLAEVLKVVSPDPLAAVEAAEAAFEVLLRLIRVAVELHGLDEEELVELAVRKLREARREIEKESREERELERRLLEIRAEIDPEEVAKELEKEIEELKKNIEEALKKLEEFFEKVQERIKELPERERELVEKLATAFLELMLTVIRNSVERLLELALLLAKVLVKLGKYEEAFEVIKEAVRLAKEVVRKLEELAERSESEELREHALETAAEILARAIKALAEAIKAFADKDPEIAEELFELMLELLEELERLVRRAVERGFPRVVRHLGPAVKALAEAALHHPNREEALERAVERLRRLLEELERLAERVEREEEDPVRRLALLAALAEAQVAVLEALARLSEHLPEERRKEVEEWLKKRVLELLERLLELLREAEELYRRTGDERLREIARELRRILERLAEVTEGSLELAEAAWELLAPHPEAFGARAEVVVNLAKLDPERGLRALEELEKQVSTEEQREALAYALGRIVGYVDEERAKELIDRAIELGQYDAFAEGLAEALLEAPEERIPKLLKAIEEFLKKLEEELKEIEKKINEPEFQKSKDEEEKKKIKERLKKIFRAASIIAETSAKLLDKAPLLALRVAKLALRNIEKASELLEKI

MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTEVTVLTASSPDEIPAIAERVLELTGDREVAERVREAMAELWRALAAMPDVVIGGLALLDYPDVVVLVEGPRPASEEARLLTLAHQIAHGIFARLAREAGVDLSLPEVRAANEGVATFAGLAEMLGVASVEEAARAAFDWYLGDPRARERAARLPVTLEQLVRMVREVVKLAEIYRRAREQGLLPAEFTDAHLGGTAVAMDILLFVGEARLEEEAERVERDEDLSEEEKKALRVILTAKALILLALGLLALLARHPDNKEVKELVLRLANLLIEQVERLLEEAKKIEDKVPELAAEAIRLLARALLVLAELLLRLSPYFPEEVKENGRLLGEVALKLLELLKKLLEKAEKEGNKEIHELIAEAIAALIGVADALRRLGLEEEAEELKKKIAELVNKLVESYPEQLFKLIEKTLDHPETLAEVLSQVKLTKELAKELFEKALEAIKEKNYKLAYLYLTAAATNPEMLPKIKELLEKEEDIEVIKVIAKAAITAANNENLTKEQAELLAELLLLALEKLIPDEELLELIIKILKALAKLFKKLDPKTAIEYLKKVTELVLELLEREKDPERIIKLGEALAKLLEGVGENAAKTKDKELVKTAIELAKEVIEKILKRLLEDKSLSPEEVAALVEAIVKIAEGTIKALILAGLLEEALEFLKEVLEKIVETIEQLPDELRPEAIAALLESLGESLVEIAKTALENLPEEEAEKFLKEVLRLILEFLEKLFEIALPLADDKEAVEKIMKGLAKLVGGLLVVLLLVPGVEEEVRRIIRLITEFIEEVFRRMVEKAETEEEREEVREFIAELLLEFLKIIGEKVVKGTEEAVRKGLLKPEGLRAALRLLGELVEALLRLAAELLPEELAREVAREMLEIAFETLAEVLKVVSPDPLAAVEAAEAAFEVLLRLIRVAVELHGLDEEELVELAVRKLREARREIEKESREERELERRLLEIRAEIDPEEVAKELEKEIEELKKNIEEALKKLEEFFEKVQERIKELPERERELVEKLATAFLELMLTVIRNSVERLLELALLLAKVLVKLGKYEEAFEVIKEAVRLAKEVVRKLEELAERSESEELREHALETAAEILARAIKALAEAIKAFADKDPEIAEELFELMLELLEELERLVRRAVERGFPRVVRHLGPAVKALAEAALHHPNREEALERAVERLRRLLEELERLAERVEREEEDPVRRLALLAALAEAQVAVLEALARLSEHLPEERRKEVEEWLKKRVLELLERLLELLREAEELYRRTGDERLREIARELRRILERLAEVTEGSLELAEAAWELLAPHPEAFGARAEVVVNLAKLDPERGLRALEELEKQVSTEEQREALAYALGRIVGYVDEERAKELIDRAIELGQYDAFAEGLAEALLEAPEERIPKLLKAIEEFLKKLEEELKEIEKKINEPEFQKSKDEEEKKKIKERLKKIFRAASIIAETSAKLLDKAPLLALRVAKLALRNIEKASELLEKI
Protein #2 42 residues (26% resolved)

DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIA

DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIA
Non polymer #3 ZN

InChI=1S/Zn/q+2

[Zn+2]
Download coordinates
Reference