2026-08-01_00000183|hard|23WM

Cryo-EM structure of the de novo designed metalloprotease PP507 E110Q mutant; Electron microscopy 3.13Å
Protein #1 1552 residues (17% resolved)

MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTRQQNLDVLDKIVVYPEGEYDREKADAIVDALAWIPLKYLQALLDAGVKIVLANSEELLELLKKYPRLRDLIRALIEVAKMTVGVGDGGDKRAYINIEGSVEGVRLLALHQTAHVIDDVVLNSISLSPIFLKYFEYLKKLLLEALKKKPEALKNYELNKKILDKLENEELTPEEIRELVRKMKENIVGLSAAYLGTYPEEAFAWGFAAYALRRGGDEEGLERFRRYLMRTSGLDPESVEKVLDALIEMGEFAAELGELEELLKKAKEKAKKEKTEAAKEALKIAETLSLAAEIALELEVLLLEFPDDLEVHRLALRATRLLLEVVEEILRKAEKLVDEAPELVAMVAALAARVLALLARNLLRLPEELAEEAREAGRLLGEVALKLLELLKKLLEKAEKEGNKEIHELIAEAIAALIGVADALRRLGLEEEAEELKKKIAELVNKLVESYPEQLFKLIEKTLDHPETLAEVLSQVKLTKELAKELFEKALEAIKEKNYKLAYLYLTAAATNPEMLPKIKELLEKEEDIEVIKVIAKAAITAANNENLTKEQAELLAELLLLALEKLIPDEELLELIIKILKALAKLFKKLDPKTAIEYLKKVTELVLELLEREKDPERIIKLGEALAKLLEGVGENAAKTKDKELVKTAIELAKEVIEKILKRLLEDKSLSPEEVAALVEAIVKIAEGTIKALILAGLLEEALEFLKEVLEKIVETIEQLPDELRPEAIAALLESLGESLVEIAKTALENLPEEEAEKFLKEVLRLILEFLEKLFEIALPLADDKEAVEKIMKGLAKLVGGLLVVLLLVPGVEEEVRRIIRLITEFIEEVFRRMVEKAETEEEREEVREFIAELLLEFLKIIGEKVVKGTEEAVRKGLLKPEGLRAALRLLGELVEALLRLAAELLPEELAREVAREMLEIAFETLAEVLKVVSPDPLAAVEAAEAAFEVLLRLIRVAVELHGLDEEELVELAVRKLREARREIEKESREERELERRLLEIRAEIDPEEVAKELEKEIEELKKNIEEALKKLEEFFEKVQERIKELPERERELVEKLATAFLELMLTVIRNSVERLLELALLLAKVLVKLGKYEEAFEVIKEAVRLAKEVVRKLEELAERSESEELREHALETAAEILARAIKALAEAIKAFADKDPEIAEELFELMLELLEELERLVRRAVERGFPRVVRHLGPAVKALAEAALHHPNREEALERAVERLRRLLEELERLAERVEREEEDPVRRLALLAALAEAQVAVLEALARLSEHLPEERRKEVEEWLKKRVLELLERLLELLREAEELYRRTGDERLREIARELRRILERLAEVTEGSLELAEAAWELLAPHPEAFGARAEVVVNLAKLDPERGLRALEELEKQVSTEEQREALAYALGRIVGYVDEERAKELIDRAIELGQYDAFAEGLAEALLEAPEERIPKLLKAIEEFLKKLEEELKEIEKKINEPEFQKSKDEEEKKKIIEKLKKIKRAARIVLEAALKVLLKAPELASRVAKLALEIISKVERILKKI

MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTRQQNLDVLDKIVVYPEGEYDREKADAIVDALAWIPLKYLQALLDAGVKIVLANSEELLELLKKYPRLRDLIRALIEVAKMTVGVGDGGDKRAYINIEGSVEGVRLLALHQTAHVIDDVVLNSISLSPIFLKYFEYLKKLLLEALKKKPEALKNYELNKKILDKLENEELTPEEIRELVRKMKENIVGLSAAYLGTYPEEAFAWGFAAYALRRGGDEEGLERFRRYLMRTSGLDPESVEKVLDALIEMGEFAAELGELEELLKKAKEKAKKEKTEAAKEALKIAETLSLAAEIALELEVLLLEFPDDLEVHRLALRATRLLLEVVEEILRKAEKLVDEAPELVAMVAALAARVLALLARNLLRLPEELAEEAREAGRLLGEVALKLLELLKKLLEKAEKEGNKEIHELIAEAIAALIGVADALRRLGLEEEAEELKKKIAELVNKLVESYPEQLFKLIEKTLDHPETLAEVLSQVKLTKELAKELFEKALEAIKEKNYKLAYLYLTAAATNPEMLPKIKELLEKEEDIEVIKVIAKAAITAANNENLTKEQAELLAELLLLALEKLIPDEELLELIIKILKALAKLFKKLDPKTAIEYLKKVTELVLELLEREKDPERIIKLGEALAKLLEGVGENAAKTKDKELVKTAIELAKEVIEKILKRLLEDKSLSPEEVAALVEAIVKIAEGTIKALILAGLLEEALEFLKEVLEKIVETIEQLPDELRPEAIAALLESLGESLVEIAKTALENLPEEEAEKFLKEVLRLILEFLEKLFEIALPLADDKEAVEKIMKGLAKLVGGLLVVLLLVPGVEEEVRRIIRLITEFIEEVFRRMVEKAETEEEREEVREFIAELLLEFLKIIGEKVVKGTEEAVRKGLLKPEGLRAALRLLGELVEALLRLAAELLPEELAREVAREMLEIAFETLAEVLKVVSPDPLAAVEAAEAAFEVLLRLIRVAVELHGLDEEELVELAVRKLREARREIEKESREERELERRLLEIRAEIDPEEVAKELEKEIEELKKNIEEALKKLEEFFEKVQERIKELPERERELVEKLATAFLELMLTVIRNSVERLLELALLLAKVLVKLGKYEEAFEVIKEAVRLAKEVVRKLEELAERSESEELREHALETAAEILARAIKALAEAIKAFADKDPEIAEELFELMLELLEELERLVRRAVERGFPRVVRHLGPAVKALAEAALHHPNREEALERAVERLRRLLEELERLAERVEREEEDPVRRLALLAALAEAQVAVLEALARLSEHLPEERRKEVEEWLKKRVLELLERLLELLREAEELYRRTGDERLREIARELRRILERLAEVTEGSLELAEAAWELLAPHPEAFGARAEVVVNLAKLDPERGLRALEELEKQVSTEEQREALAYALGRIVGYVDEERAKELIDRAIELGQYDAFAEGLAEALLEAPEERIPKLLKAIEEFLKKLEEELKEIEKKINEPEFQKSKDEEEKKKIIEKLKKIKRAARIVLEAALKVLLKAPELASRVAKLALEIISKVERILKKI
Protein #2 42 residues (19% resolved)

DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIA

DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIA
Non polymer #3 ZN

InChI=1S/Zn/q+2

[Zn+2]
Download coordinates
Reference