2026-06-06_00000288|hard|9YNB

Structure of the T6SS effector protein PdpC; Electron microscopy 3.40Å
Protein #1 1372 residues (66% resolved)

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSDYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDKENLYFQGNDKYELNIYFEKIELPKTADFNMISKHDIKELRVDANLKKKIHLLQFDEDYLAYMRSLRAIHPSKIAMQKIKSIRNKEDSFIIAIFSLDKIIHKTKFISFGHKTVIFDFKKLWGLVDFVIVHTSNKTWVNHKLTSFMPSITYCNQNIIHLAYHSDFLYIYHTPEFMDDINVDRENRRELVAKIPDPYWVRADTKENKININSEEENIEKDLKKITKLKNFEISANDIFFSKAIKAAPRLQHKNKSKLFNSLAIENNEKIKRDIIDYAISNAWYKNEGLLENLMTFLDALVVRHLYLIAVYSVYEIEIGIKSVKPEYSKLLKAGLLNKDIQNQLIYDQKKISNIIWLGETFHGLDIEEAEDLCELIDQGDINPKINPINPEKLYRAYKENYGNEALSFREYKEKYNFLDNDKLREEHANKLSSILEDPKFRVLSYINAFLCSTKNYLVPYGYLGSNPLTYYNCMLETGKRRTSKEAYFADIRNKLFMVCYLPGFLSSVIADDDFIDWYSNKKENQELLKNSYLNNLYKSKQKYIKDFIDLDIIKLLKQTSSQIKPSYIPVAFRYGAFASTTALIRSNANVSNRMEFELYDSPERLHNQYSEKEEMIMPKSVNNPKDHSIDNGISLFSLNLTNEKEDGLRKVMLKVAQLYNLDFKVGISGNLDQAMTQALILGMATTKKNGDILLDEDQMLYMTYLYCIFMAHSVDHTVDEILMSANTYLLNSEEVKYPIFNIADFFARPVFGLSKDKEFKSLVEKYENSLKPNSKILKENYISRVVTLSEVYEVYEDLNCLYSSLSEGSLYNLLSTHSERHCTLLEQYSRKKKAEIGLVQDGEKIKVVNNYSGYAAINQYQRFVSLGRMYDSGAKYSSSHKKQIEKDFNLYLPDKEQINYLKYNFKDNKFDAVYKNKKSKEKNQSHIVYAKKQNTRYCYGYFNDFFVKNRITTFYKIKDKSGNYLVNLHNEKYSFATPNSDSKIYRVSPELLNNRDDFKRVSKDIIKSYKYISFDKQKEDIVKNFGKNLYHTNYEIWVGLSHQAISCFSVLDNIDTQEAANTFIDALYYVRLMQLYYGKTIPFLWISSEIVRYSSSETHYYIPTEENFENILKIALNNASKPVIERFLIILNIYNSTIDNNALILIRCRLPIILFEYEEQKLKLKALQKCADSYKKNNYKNEINFSAWFESIFHVQNLSLSPNYIGNNILILSLVEELKPKCSEYKKNMINQQITAKANELNFYQLLIRLIEISTYHRILTKSIITNTTSLLYDILNKPEFQTINKLINKLFIYKNKDLNTDKYKAFHTKLITIESTYKKINSLYKSDFFKKISS

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSDYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDKENLYFQGNDKYELNIYFEKIELPKTADFNMISKHDIKELRVDANLKKKIHLLQFDEDYLAYMRSLRAIHPSKIAMQKIKSIRNKEDSFIIAIFSLDKIIHKTKFISFGHKTVIFDFKKLWGLVDFVIVHTSNKTWVNHKLTSFMPSITYCNQNIIHLAYHSDFLYIYHTPEFMDDINVDRENRRELVAKIPDPYWVRADTKENKININSEEENIEKDLKKITKLKNFEISANDIFFSKAIKAAPRLQHKNKSKLFNSLAIENNEKIKRDIIDYAISNAWYKNEGLLENLMTFLDALVVRHLYLIAVYSVYEIEIGIKSVKPEYSKLLKAGLLNKDIQNQLIYDQKKISNIIWLGETFHGLDIEEAEDLCELIDQGDINPKINPINPEKLYRAYKENYGNEALSFREYKEKYNFLDNDKLREEHANKLSSILEDPKFRVLSYINAFLCSTKNYLVPYGYLGSNPLTYYNCMLETGKRRTSKEAYFADIRNKLFMVCYLPGFLSSVIADDDFIDWYSNKKENQELLKNSYLNNLYKSKQKYIKDFIDLDIIKLLKQTSSQIKPSYIPVAFRYGAFASTTALIRSNANVSNRMEFELYDSPERLHNQYSEKEEMIMPKSVNNPKDHSIDNGISLFSLNLTNEKEDGLRKVMLKVAQLYNLDFKVGISGNLDQAMTQALILGMATTKKNGDILLDEDQMLYMTYLYCIFMAHSVDHTVDEILMSANTYLLNSEEVKYPIFNIADFFARPVFGLSKDKEFKSLVEKYENSLKPNSKILKENYISRVVTLSEVYEVYEDLNCLYSSLSEGSLYNLLSTHSERHCTLLEQYSRKKKAEIGLVQDGEKIKVVNNYSGYAAINQYQRFVSLGRMYDSGAKYSSSHKKQIEKDFNLYLPDKEQINYLKYNFKDNKFDAVYKNKKSKEKNQSHIVYAKKQNTRYCYGYFNDFFVKNRITTFYKIKDKSGNYLVNLHNEKYSFATPNSDSKIYRVSPELLNNRDDFKRVSKDIIKSYKYISFDKQKEDIVKNFGKNLYHTNYEIWVGLSHQAISCFSVLDNIDTQEAANTFIDALYYVRLMQLYYGKTIPFLWISSEIVRYSSSETHYYIPTEENFENILKIALNNASKPVIERFLIILNIYNSTIDNNALILIRCRLPIILFEYEEQKLKLKALQKCADSYKKNNYKNEINFSAWFESIFHVQNLSLSPNYIGNNILILSLVEELKPKCSEYKKNMINQQITAKANELNFYQLLIRLIEISTYHRILTKSIITNTTSLLYDILNKPEFQTINKLINKLFIYKNKDLNTDKYKAFHTKLITIESTYKKINSLYKSDFFKKISS
Download coordinates
Reference