2026-01-17_00000189|hard|9LM6

Cryo-EM structure of prefusion-stabilized RSV F (DS-Cav1 strain: A2) in complex with nanobody 1D8; Electron microscopy 3.26Å
Protein #1 569 residues (80% resolved)

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITIELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAKKTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVCKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAVVSLSNGVSVLTFKVLDLKNYIDKQLLPILNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYMLTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMCIIKEEVLAYVVQLPLYGVIDTPCWKLHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEVNLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVSNKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIRKSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLEAAAKEAAAKEAAAKHHHHHHHHHH

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITIELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAKKTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVCKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAVVSLSNGVSVLTFKVLDLKNYIDKQLLPILNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYMLTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMCIIKEEVLAYVVQLPLYGVIDTPCWKLHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEVNLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVSNKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIRKSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLEAAAKEAAAKEAAAKHHHHHHHHHH
Protein #2 139 residues (89% resolved)

MQLQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASEHTYCFYDMSWYRQAPGKEREFVSGIDIDGSARYADSVKGRFTISQDNAANTVYLQMNSLKPEDTAMYYCKTRLCGEADTYCSGGDCRDSGYWGQGTQVTVSSSRGSHHHHHH

MQLQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASEHTYCFYDMSWYRQAPGKEREFVSGIDIDGSARYADSVKGRFTISQDNAANTVYLQMNSLKPEDTAMYYCKTRLCGEADTYCSGGDCRDSGYWGQGTQVTVSSSRGSHHHHHH
Download coordinates
Reference