2026-01-17_00000188|hard|9LM5

Cryo-EM structure of prefusion-stabilized RSV F (DS-Cav1 strain: A2) in complex with nanobody 1G9; Electron microscopy 2.77Å
Protein #1 569 residues (80% resolved)

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITIELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAKKTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVCKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAVVSLSNGVSVLTFKVLDLKNYIDKQLLPILNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYMLTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMCIIKEEVLAYVVQLPLYGVIDTPCWKLHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEVNLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVSNKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIRKSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLEAAAKEAAAKEAAAKHHHHHHHHHH

MELLILKANAITTILTAVTFCFASGQNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITIELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPATNNRARRELPRFMNYTLNNAKKTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGVAVCKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAVVSLSNGVSVLTFKVLDLKNYIDKQLLPILNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYMLTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMCIIKEEVLAYVVQLPLYGVIDTPCWKLHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEVNLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVSNKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIRKSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLEAAAKEAAAKEAAAKHHHHHHHHHH
Protein #2 137 residues (96% resolved)

MQLQLVESGGGAVQSGGSLRLSCAASGDTYSIYSMGWFRQAPGREREGVAAIFSDGSTNYAASVEGRFTISQDNAENTLYLQMNSLKPEDTAMYFCAAGNAAWGLVDYYTEADFAYWGQGTQVTVSSSRGSHHHHHH

MQLQLVESGGGAVQSGGSLRLSCAASGDTYSIYSMGWFRQAPGREREGVAAIFSDGSTNYAASVEGRFTISQDNAENTLYLQMNSLKPEDTAMYFCAAGNAAWGLVDYYTEADFAYWGQGTQVTVSSSRGSHHHHHH
Download coordinates
Reference